平々凡々の女子中学生・初野美空はある日、ある紳士に誘われ、不思議な場所に足を踏み入れる。 そこにいたのは、縄文、弥生などの擬人化達十七人。 擬人化男子達は美空本人さえ知らないある秘密を知っていてーーー！？ 「まぁ......君が好きなら別に良いけど」 縄文。 ｢芸は身を助くるて言う。世の中に覚えておいて損なものはなかばい｣ 弥生。 「古墳は王の墓やねん。ロマンが詰まっとるやろー？」 古墳。 「遣隋使の時代なのですよー！」 飛鳥。 「ん〜、まぁまぁだろ」 奈良。 「若い者には幸せになってほしいですねぇ」 平安。 「日ノ本の歴史に携わる身、"若輩者だから"で許されるか？」 鎌倉。 「僕は南朝」「俺は北朝」 南北朝。 「怒っちゃった？ごめん。徳政令でチャラにして？」 室町。 「辛い時には私達がついていることを忘れないで頂きたく。特に私を忘れないで頂きたく！」 戦国。 「日本一の色男、安土桃山であります！」 安土桃山。 「別にアンタと仲良くなりたいとか思ってないし！！」 江戸。 「思い出というのは綺麗に見えるんですよ」 明治。 「美空っち可愛い〜！ラジオ巻き、似合ってるよ！」 大正。 「体は資本。ま、俺 もちっとばかし前までは御寮人みてぇにやんちゃしていたけど......」 昭和。 「気楽に生きた方が絶対楽しいって〜！」 平成。

熱帯雨林のように蒸し暑い夏の日、昼寝から目覚めると、望月柚は思いもよらぬ明治時代にタイムスリップしていた。偶然にも死ニカエリと呼ばれる怪異に襲われそうになるが、内務省討伐課の警察官、入谷咲真と同僚の大山勇に救われる。彼らの提案で、衣食住を保障される代わりに、柚は死ニカエリの捜査に協力することに。予想外の冒険と奇妙な事件の数々を経て、柚は次第に勇に惹かれていく。 そんな時、元の時代に戻れる唯一のチャンスが迫って......！？

ただ、がむしゃらに生にしがみついた。 それは、熱くて、苦しくて、悲しくて、悔しかった。 貴方と、生きていたかった。 本当は、誰も死にたくなかった。 ｢仕方ないね｣なんて、そう割り切れたら良かった。 叫びは声にならず、願いは形にならず、願いは誰にも届かなかった。 それが世界だった。 私の想い人は、神様になる人です。