軍事オタクであることを除けばごく普通の高校2年生の吉田勇樹は、 ある日突然、太平洋戦争中の日本にタイムスリップしてしまった！ そこで出会う名だたる軍人や軍艦に困惑しつつも、次第に吉田は戦争の渦に巻き込まれていく。 果たして太平洋戦争の行く末と吉田の運命はどうなるのか？

広大なジャングルの中にあるB73地区、ここは最も治安が悪い場所でもあった そのため時おり紛争も発生し、政府当局は必死に鎮圧活動を行っていた そしてその隣国に位置する、密林のC保安地区ではアメリカ陸軍歩兵師団支援隊による難民の物資支援及び護送任務がおこなわれていたのである ある日、支援隊に所属する一人の若き日本人、尾上二等兵 その同期のアメリカ人、ニック二等兵は物資輸送のためC保安地区に派遣される 派遣された2日後、突如C地区は爆撃と戦車による総攻撃にあい、最低限の装備しか持っていない彼らは呆気なく捕虜にされてしまった 命からがらその場から逃げ出した尾上二等兵 しかし 路上で敵の戦車に追われているニックを発見する 何もできないニックに応戦するように呼び掛ける 銃とわすが2個しかない手榴弾で何とか戦車の足を止めることはできたものの、後続の戦車も迫っており、密林へと命からがら逃げることになる 何とか逃げ延びることができたが、後に戻ることもできない2人。地図も何もない彼らは密林の中をさまようのであった

ついに始まったミッドウェー島攻略作戦。海軍中佐となった吉田勇樹は、日本を勝利に導くための指揮官として奮闘する。 しかし、待ち受ける困難の数々。吉田が艦長を任された重巡洋艦「三隈」に、多数の魚雷が迫る。 果たして、軍配はアメリカと日本、どちらに上がるのだろうか？