私立探杜（みもり）中学校には、校内の紛失物を探し出す専門組織、通称「ウラ生徒会」が存在する。拠点は生徒会室横の古い倉庫室。そこは教会の「告解室」のような造りで、依頼主は顔を隠したメンバーに探し物の依頼をする――。 中学二年生の久我結城（くが ゆうき）は、幽霊や物の記憶が「視える」体質。かつて善意で霊からの伝言をクラスメイトに伝えた際、「プライバシーを覗き見している」と気味悪がられ、いじめに遭った過去が深いトラウマになっている。 転校先では静かに過ごすと決めていた結城だったが、ある放課後、落とし物の髪飾りを巡り「付喪神（つくもがみ）」と交渉している現場を、クラスメイトの黒川慧（くろかわ けい）に見られてしまい、半ば強引に「ウラ生徒会」へスカウトされ、バディを組むことに。 「成績を落とさない」「正体を隠す（対面時は赤ちゃんやウマの被り物を着用）」といった奇妙な掟を課されながらも、結城は慧と共に、渋々ながらも「探し物」の依頼を解決し始める。